O PPGMQ-MG possui cotas de bolsas de estudo da CAPES e da FAPEMIG, que são distribuídas de acordo com a classificação geral do processo seletivo (modalidades CAPES-GERAL e FAPEMIG-GERAL). Adicionalmente, o programa conta com bolsas que são gerenciadas e distribuídas diretamente pelas IES associadas, em conformidade com suas normas internas. As bolsas vinculadas às IES podem ter diversas origens, como cotas institucionais da CAPES, FAPEMIG, CNPq, programas de fomento próprios ou parcerias com empresas.
As tabelas a seguir apresentam os discentes bolsistas ativos de mestrado e doutorado no PPGMQ-MG.